A lo que vamos por si le sirve a alguien mas.
1º Abrimos iFile y vamos a la ruta etc/apt/sources.list y editamos el archivo cydia.list, borramos la entrada que hace referencia al enlace erroneo, en mi caso es esta "GSMspain.com - ENLACE EXTERNO a
Debes estar logueado para poder ver los enlaces." Supongo que servirá para otro tipo de entradas erróneas.
2º Sin cerrar iFile no dirigimos a la ruta var/lib/apt/list de ahí he borrado los archivos que hacían referencia al error de cydia, en mi caso creo que había 2 ficheros.
3º Seguimos sin cerrar iFile y nos vamos a la ruta var/lib/cydia de ahí he borrado el archivo metadata.plist. Este paso decidí darlo porque según todo lo leído por mi, solo hacia falta en algunos casos la parte 1ª y en otros la 1ª y 2ª, pero en ambos supuestos al entrar a cydia me volvía a salir la repo errónea y el consiguiente mensaje de error, pero borrando el archivo metadata.plist se soluciono la cosa, eso si, perdí las repos que metí a mano pero sin problemas, se meten de nuevo y listo.