[AYUDA] Guardar la configuración de las aplicaciones

¿Existe alguna forma de realizar una copia de seguridad de las aplicaciones de tal modo que no sea necesario reactivarlas de nuevo?

Un ejemplo concreto sería Whatapps que hay que activarlo mediante un SMS. ¿Cada vez que flasheo el Galaxy S con una ROM nueva tengo que volverlo a activar?

Sé que hay programas que te restauran el software que tenías pero pierden la configuración o la activación.